10 X Genomics单细胞mRNA测序是一种在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序的新技术。10 X Genomics平台能够一次性分离500~10000个单细胞,并能够将分离的单个细胞中的微量mRNA通过高效扩增后再进行高通量测序,有效地解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题,有助于发现新的细胞类型;其基于大量的单细胞基因表达数据,可以提供细胞表达特征聚类、亚群表达特征的分析、标志物筛选等方面的分析,是一种高效的细胞基因表达水平的检测技术,在生殖、免疫、干细胞分化、肿瘤发生发展等研究领域中有着广泛的应用。
◆通量高
8个样本同时进行,每个样本可测500-10000个细胞
◆捕获效率高
捕获效率高达65%以上
◆应用范围广
动植物细胞、肿瘤细胞异质性、肿瘤微环境、免疫细胞群体检测等
◆成本低
单个细胞的费用从几千元降低到几十元
◆周期短
6分钟内完成上万个细胞封装,一天之内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库
1. 细胞总量:细胞不低于106个;浓度不低于1000cell/μL,每个样本不少于100μL;
2. 细胞活性:细胞存活率大于90%(活性越高越好,至少80%);
3. 细胞大小:细胞直径不超过40μm;
4. 悬浮液中细胞不能成团(显微镜),少碎片,不要存在反转录抑制剂及非细胞的核酸分子,尽量保证细胞的完整性。
5. 培养基及缓冲液中不能含有Ca2+和Mg2+等影响酶活性的物质。
1. 新鲜组织(不可冻存)
Tips:由于福尔马林固定引起的化学变化,单细胞基因组测序技术目前仅限于新分离的组织样本。
2. 贴壁或悬浮培养细胞,单细胞悬浮液,干细胞,浸润淋巴细胞等。
3. 全血PBMC细胞悬液
细胞表达特征聚类、亚群表达特征的分析、标志物筛选等方面的分析。