miRNA测序

       microRNA是一类内生的、约有22个核苷酸组成的非编码小分子RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可以调节多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。研究表明，microRNA可作为一些已知疾病的生物标记物，并参与机体各种生理活动，如细胞生长凋亡、心脏发育、胚胎后期发育等。通过高通量测序，可以发掘、鉴定和定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱、挖掘新的miRNA分子、预测靶基因、分析样品间的miRNA差异表达。
 
 

主要研究策略：

 
1、探究某miRNA与肿瘤的增殖相关的具体调控机制；
2、寻找在抑制或促进肿瘤细胞凋亡方面发挥作用的miRNA；
3、探究肿瘤的血管形成、肿瘤的转移等肿瘤微环境相关的发生机制；
4、探究某种疾病的能量代谢、免疫等相关机制；
5、寻找与肿瘤基因组不稳定性的相关性等。
 

技术参数：

样本类型：血清、血浆、细胞培养上清、动植物细胞、组织等
 
 

分析内容：

1、数据产出统计和质量评估；
2、reads与参考序列比对；
3、表达丰度统计；
4、表达水平分析；
5、差异表达基因筛选；
6、miRNA靶基因预测；
7、miRNA靶基因GO富集分析；
8、miRNA靶基因KEGG Pathway富集分析。