技术服务
......
技术服务

LncRNA

       长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA,其在细胞内数量比较多,大约是为mRNA的3-100倍。通过与DNA、RNA或蛋白质结合,在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达。通过不同的分子生物学机制调控编码基因的表达,在生产上对物种的改良,在人类健康方面参与疾病相关的信号通路从而对疾病的发生发展及治疗有重要作用。

主要研究策略:

可根据以下作用机制进行具体科研分析
1、编码蛋白的基因上游启动子区转录,干扰下游基因的表达;
2、抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰,影响下游基因(蓝色)的表达;
3、与编码蛋白基因的转录本形成互补双链,干扰mRNA的剪切,形成不同的剪切形式;
4、与编码蛋白基因的转录本形成互补双链,在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA;
5、与特定蛋白质结合,lncRNA转录本可调节相应蛋白的活性;
6、作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体;
7、结合到特定蛋白质上,改变该蛋白质的细胞定位;
8、作为小分子RNA(如miRNA、piRNA)的前体分子。

技术参数:

样本类型:细胞、全血、组织等

分析内容:

1、数据产出统计和质量评估;
2、序列比对与拼接;
3、lncRNA表达丰度统计与表达水平分析;
4、差异性lncRNA的筛选及验证;
5、预测结合的mRNA;
6、GO富集及KEGG分析。