circRNA

     环状RNA（circular RNAs，circRNAs），广泛存在于人和动植物中，是一类新的隐秘未知但却功能异常强大的非编码RNA。不同于线性RNA，circRNAs呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。这种特性，预示circRNAs有巨大潜力成为新的临床诊断标志物。最近研究证实，circRNAs是ceRNA调控网络中的重要成员，可以像“海绵”一样大量吸附miRNAs，进而调控基因表达。

主要研究策略：

1、收集对照组和实验组的样本，提取circRNA并经进行测序分析；
2、将对照组和实验组中circRNA进行对比，筛选出有差异的circRNA；
3、通过生物信息学分析差异circRNA与上游miRNA的结合位点以及miRNA下游靶基因，同时可分析circRNA在组织中的特异性以及采用GO/KEGG pathway分析circRNA与通路的相关性；
4、筛选与疾病或药物作用相关的circRNA。

技术参数：

1、样本类型：组织、细胞、全血等；
2、测序策略：HiSep PE 150

分析内容：

1、数据产出统计和质量评估；
2、reads与参考序列对比；
3、表达丰度统计与表达水平分析；
4、差异性circRNA的筛选及验证；
5、预测结合的miRNA；
6、circRNA来源基因分析以及miRNA靶基因筛选；
7、GO富集及KEGG分析。