真菌denovo测序

       真菌基因组测序主要针对无参考序列的物种进行测序，样品基因组测序后从头开始组装。对于真菌样品，由于基因组较大且比较复杂，推荐先对真菌样品进行初级组装，再根据初级组装的结果进行高级组装，以提高组装质量。根据组装结果，可预测真菌基因组中包含的基因，通过功能数据库比对可得到基因的功能注释信息。真菌基因组测序在研究植物致病性真菌、生物防治真菌等方面有重要的应用。

       根据不同的研究目的与需求，以及不同的组装程度需求，真菌基因组测序提供以下两种产品类型：真菌框架图、真菌精细图。

项目流程：

技术参数： 

分析内容：

1.数据质控
2.Denovo组装
3.基因组组分分析（基因预测、重复序列、非编码RNA）
4.基因功能注释（COG、KEGG、NR、GO、Swiss-prot）
5.致病性分析（分泌蛋白预测、PHI、细胞色素P450、CAZy）
6.比较基因组分析（共线性分析、Core-pan分析、进化分析）