宏基因组测序

       宏基因组学 (metagenomics) 是一种以特定环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，直接对微生物群体基因组进行测序。环境微生物通常以群落方式共存和互作，宏基因组研究比单个个体研究更能反映微生物的真实生存状态。

       通过对环境样品中的total DNA进行高通量测序，用以研究微生物多样性、种群结构、进化关系、基因功能等。

技术参数 ：

1.基因组DNA，样本总量≥3 μg，样本浓度：≥50 ng/μL
2.项目周期：45-60个工作日

分析内容：

1.数据质控；
2.序列组装；
3.基因预测及非冗余基因集构建；
4.非冗余基因集功能注释(Nr注释、COG功能注释、KEGG代谢通路注释等)；
5.基于SSU序列或直接基于reads binning物种分类统计；
6.基于非冗余基因集或者直接基于reads binning功能构成分类统计；
7.基于多样本物种组成多样性分析(Alpha多样性分析、Beta多样性分析以及LEfSe分析等)；
8.优势物种的基因组独立分析